Котят точно нельзя было вместе с мамой везти. Конечно она разнервничалась, стала детей защищать. На таких нервах и передавить могла запросто.
Снимите верх переноски если он снимается. Поставьте переноску или коробку с котеями если удастся переложить в тихое по возможности темное место. Чтобы никто рядом не ходил особо. Ну и чтобы не холодно было, и не было затхлого воздуха (т.е. не в кладовку). Поставьте туалет и корм с водой прямо возле коробки с котеями, чтобы кошке не нужно было далеко уходить от гнезда.
Потом когда она немного успокоится, возьмите котенка и сфоткайте пузо крупным планом в хорошем качестве. Может, здесь смогут знающие заводчики посоветовать подходящее лечение.